A morte de Vicente Bermudez Zacarias foi captada por uma câmara de vigilância e aconteceu em plena luz do dia.
O juiz morreu com um único tiro, disparado na zona da nuca.
Bermudez Zacarias, de 37 anos, era responsável pela análise de recursos do caso de "El Chapo" e de outro antigo líder de um cartel mexicano.
Joaquín "El Chapo" Gúzman é um dos narcotraficantes mais conhecidos em todo o mundo. Foi recapturado em janeiro, sete meses depois de fugir da prisão.
As autoridades mexicanas pretendem extraditar "El Chapo" para os Estados Unidos no início do próximo ano.