A forma como Mendes Calado foi exonerado levantou uma onda de críticas e levou mesmo o Presidente da República a desautorizar o ministro da Defesa.
Três meses depois de conhecida a intenção do Governo de nomear Gouveia e Melo para chefiar a Marinha, o processo continua envolto em polémica.
Agora, o Presidente da República considera que afinal os equívocos já estão ultrapassados e descongelou o processo com muitas críticas de militares e não só. Marcelo Rebelo de Sousa fala de um novo ciclo político e de uma nova orgânica nas Forças Armadas.
O almirante Mendes Calado, que agora cessa funções, já deixou claro que deixa a Marinha, mas não "por vontade própria".